Лекторий Сколтеха на Дальнем Востоке

Новые методы определения пространственной структуры хроматина в сопоставлении с эпигеномными и транскриптомными данными показывают, что пространственно сближенные участки хроматина склонны находиться в одном и том же функциональном состоянии. Плотно упакованные участки, ТАДы (топологически ассоциированные домены) обеднены активными гистоновыми метками, в них преимущественно располагаются тканеспецифичные гены. Участки между ТАДами активно транскрибируются. 

Молекулярная палеонтология

Можно ли прочитать геном мамонта? Да, уже прочитали. А неандертальца? Тоже. А динозавра? Нет. А если очень хочется? Все равно нельзя, молекулы не сохранились — но есть способ эту проблему обойти. А что потом с этими последовательностями делать? Изучать, там много интересного…

Молекулярная эволюция

Мы привыкли думать про эволюцию в терминах анатомии и физиологии, однако в основе всего лежат изменения молекул — белков, РНК и ДНК. Сравнение геномов позволяет устанавливать родственные связи между современными живыми существами, описывать распространение устойчивости к антибиотикам у бактерий и лекарственной устойчивости у раковых клеток, моделировать работу иммунной системы. Оказывается, основы, заложенные еще Дарвином, удивительно хорошо подходят для описания и моделирования эволюции на молекулярном уровне.

Нестрашное ГМО

Что страшнее — помидор с геном трески или треска под маринадом? "Пластмассовая" клубника из супермаркета — результат генетической модификации или обычной селекции? А ядовитый картофель? На каких полях используют больше химии — там, где растят ГМО или традиционные сорта? Правда ли, что в ГМО-помидорах есть гены, а в обычных помидорах их нет? Почему надпись на пачке с солью "не содержит ГМО" показывает, что вас хотят обдурить? Так надо ли бояться ГМО? (Спойлер: нет, не надо).

Возможности секвенирования нового поколения (NGS)

Развитие технологий секвенирования вышло на количественно новый уровень, на котором сравнительно быстро и недорого можно прочесть большое число нуклеотидных последовательностей. Эту информацию можно использовать, например, для изучения упаковки хроматина, процесса транскрипции, взаимодействия белков с ДНК и РНК, изменения экспрессии генов в ответ на пертурбации и т.п. Все эти вопросы содержат в себе прикладные математические задачи, которые так или иначе сводятся к анализу биологических последовательностей. В лекции будет дан обзор современных методов секвенирования, их преимуществ и ограничений, а также связанных с ними математических задач.

Что умеет РНК?

Гипотеза мира РНК была высказана первооткрывателем архей Карлом Ричардом Вёзе, который предположил, что на начальных этапах возникновения жизни на Земле функцию хранения генетической информации и катализ химических реакций выполняли ансамбли самовоспроизводящихся молекул рибонуклеиновых кислот, из которых впоследствии развилась современная ДНК-РНК-белковая жизнь. Структурированные молекулы РНК и по сей день сохранили за собой многие "ключевые должности" в иерархии биохимических клеточных процессов. В лекции будет дан обзор современных сведений об РНК и ее интересных структурных особенностях, управляющих клеточными процессами наравне с современными белковыми машинами.